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中國人自己的單細(xì)胞測序儀來了

來源:本站  發(fā)布時(shí)間:2018-09-30 點(diǎn)擊量:892

過去兩年有一項(xiàng)大熱的技術(shù),大量研究人員通過這項(xiàng)技術(shù)解決重要科學(xué)問題,發(fā)表了大量高水平學(xué)術(shù)文章,這項(xiàng)技術(shù)便是單細(xì)胞測序技術(shù)。

單細(xì)胞測序技術(shù),在這兩年得到了蓬勃發(fā)展。一些高通量的單細(xì)胞測序平臺(tái)開始為大家所熟知。有10×genomics單細(xì)胞測序平臺(tái)、以及Fluidigm、WaferGen、Illumina/Bio-Rad等。

這些平臺(tái)在很大程度上降低了單細(xì)胞測序的成本,使得單個(gè)細(xì)胞的測序成本變得極低。雖然單個(gè)細(xì)胞的成本降低了,但一個(gè)樣本需要產(chǎn)生大量細(xì)胞的數(shù)據(jù),所以單個(gè)樣本的成本并沒有很低。大多數(shù)的研究者會(huì)因這幾十萬甚至上百萬的測序成本而對(duì)單細(xì)胞測序研究望而卻步。有些希望從事單細(xì)胞研究或者希望提供單細(xì)胞測序服務(wù)的單位,也會(huì)因?yàn)闇y序平臺(tái)高昂的價(jià)格而猶豫不決。

在這種形式下,上海凈信潛心研發(fā)兩年多,重磅推出了國內(nèi)第一家,全球第五家的單細(xì)胞測序平臺(tái)。填補(bǔ)了國內(nèi)在單細(xì)胞測序平臺(tái)制造上的空白。該平臺(tái)基于Drop-seq的技術(shù)原理,能夠一次完成數(shù)千甚至上萬細(xì)胞的單細(xì)胞測序。

大家所熟知的10×genomics單細(xì)胞胞測序平臺(tái)依托的技術(shù)手段稱之為inDrop-seq,論文在2015年發(fā)表與Cell雜志。該方法利用微液滴技術(shù)將帶有條形碼、索引分子、引物及其他的凝膠珠與單細(xì)胞混合。每個(gè)液滴內(nèi)開展逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng),以產(chǎn)生測序所用的帶有條形碼的cDNA。

10×genomics單細(xì)胞測序平臺(tái)原理圖
有意思的是,凈信使用的Drop-seq技術(shù)與inDrop-seq技術(shù)發(fā)表與同一期的Cell雜志上。Drop-seq也是利用微流控技術(shù)將細(xì)胞分開,并與帶有特定條形碼的磁珠混合。磁珠上的Poly(dT)將細(xì)胞內(nèi)的信使RNA捕獲。收集磁珠凈信逆轉(zhuǎn)錄和擴(kuò)增,得到測序所用的帶有條形碼的cDNA。與inDrop-seq不同的是,Drop-seq的逆轉(zhuǎn)錄的過程是在液滴外進(jìn)行的,這樣逆轉(zhuǎn)錄的效率會(huì)更高。

凈信單細(xì)胞測序儀原理圖
凈信的單細(xì)胞測序儀不管是從原理還是從測試結(jié)果看,都完全能媲美進(jìn)口儀器。它每個(gè)樣本能夠產(chǎn)生5000~10000個(gè)細(xì)胞,對(duì)上機(jī)樣本的要求不再那么嚴(yán)苛。為防止實(shí)驗(yàn)失敗造成的損失,機(jī)器還特別添加了能夠監(jiān)控實(shí)驗(yàn)過程的系統(tǒng),一旦出現(xiàn)管道堵塞等情況,便可以及時(shí)止損。而最最最關(guān)鍵的還是:該平臺(tái)不論是從機(jī)器的購買成本,還是試劑耗材的成本都非常低。該平臺(tái)的問世,再次將單細(xì)胞測序的價(jià)格拉低了一個(gè)臺(tái)階,使得更多的研究人員能夠去利用這一先進(jìn)的技術(shù)手段進(jìn)行研究工作。

凈信單細(xì)胞測序儀樣機(jī)圖
凈信誠邀各大測序公司、精準(zhǔn)醫(yī)療及技術(shù)服務(wù)公司一起合作,為單細(xì)胞測序的發(fā)展貢獻(xiàn)力量。有合作意向請(qǐng)撥打:021-57790908,郵箱:[email protected]

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